麻省理工学院院系设置有建筑及城市规划学院，工程学院，人文及社会科学学院，阿尔佛雷德·P·斯隆管理学院，.自然科学学院，维泰克健康科学技术学院，麻省理工—雾兹侯海洋学院:海洋学和应用海洋科技与工程联合项目，建筑和规划学院：建筑学系、城市研究与规划系以及介质艺术和科学组等;工程学院：市政工程系、电气工程与计算机科学系和材料科学与工程、化学工程系、机械工程、航空和宇航工程系、核子工程、海洋工程等系;人文和社会科学学院：语言学与哲学系、政治科学系、经济系、科学、人文学系(人类学或考古学、外国语言文学、历史学、音乐与戏剧艺术、写作计划等组)、技术和社会计划系等;斯隆管理学院：管理系;理学院：大气与行星科学系、化学系、生物学系、地球、数学系、物理系、应用生物科学计划等;怀特克尔保健科学和技术学院：脑和思维科学系、毒理学部等。
麻省理工学院重点学科：
该大学的工程系是最知名、最多人申请入读和最“难读”的学系，并曾一连七届获得美国工科研究生课程冠军，其中以电子工程专业名气最响，紧跟其后的是机械工程。其余的学科如物理学、化学、经济学、哲学、政治学也都获得好评。
麻省理工学院专业设置
麻省理工学院专业设置有政治学、信息系统、物流管理、土木工程、生物医学/生物工程、生产运营管理、经济学、金融、金融学、金融工程、计算机科学、计算机工程、机械工程、会计、环境工程/环境卫生工程、化学工程、核工程、航空航天工程、国际商务、管理、管理学、工业/制造/系统工程、高级工商管理硕士、电气工程/电子工程/通信工程、创业管理、材料工程、MBA、计算机科学与信息系统、土木结构工程、电气电子工程、机械、航空与制造工程、会计与金融、经济学和计量经济学、统计和运筹学、商业和管理研究、通信和媒体研究、社会学、社会政策与管理等
