芝加哥大学的优势专业有人类学、天文学、地球科学、经济学、地理学、历史学、语言学、物理学、数学、统计学、社会学、神学等学科在美国具有较强的学术实力，其中经济学、社会学、数学、和物理学是芝大的特色学科。以下是各个学科的排名情况。
芝加哥大学法学院
芝加哥大学法学院由捐助者约翰·洛克菲勒始建于1902年，该校自成立以来一直是美国最富声誉的法学院之一 ——2015-16年US NEWS“全美最佳法学院”排名中，芝加哥大学法学院排名第4。芝大法学院对于社会科学在法学中的运用起到了重要的推动作用，尤其以法律经济学研究中心而著称。在法学院任教的诺贝尔经济学奖获得者罗纳德·科斯（Ronald H. Coase）和美国联邦第七巡回法院理查德·A·波斯纳法官、弗兰克H.伊斯特布鲁克(Frank H. Easterbrook)法官、丹尼尔R.费舍(Daniel R. Fischel)教授等都是法律经济学的领军人物，法律经济学领域的奠基人、《法律与经济学期刊》创刊人亚伦·戴雷科特（Aaron Director）亦是芝加哥大学法学院著名教授、芝加哥经济学派重要人物之一。 此外，多位美国联邦最高法院大法官、司法部长曾毕业或执教于芝大法学院。现任美国总统贝拉克·奥巴马从1992年到2004年也在此担任宪法学讲师。美国大学多使用4.0分制或字母分级制，在严峻的就业压力下，大多数美国法学院均出现分数逐渐膨胀甚至取消评分等级的趋势。芝加哥大学法学院因为长期使用一套独有的155~186钟形曲线评分系统而著称。该系统的目的是严格控制评分，避免分数膨胀，保证分数的客观价值。
芝加哥大学商学院
芝加哥大学商学院创建于1898年，是美国最知名的商学院之一，也是首个授予博士学位和开设EMBA课程的商学院、首个产生诺贝尔奖获得者的商学院拥有8位诺贝尔得主）。2008年11月芝加哥大学商学院正式将学院改名为芝加哥大学布斯商学院（University of Chicago Booth School of Business）。此次更名是为了纪念“有效市场假说”创立者尤金·法玛（Eugene F. Fama）的弟子、芝大商学院校友大卫·布斯（David Booth）于2008年11月6日捐赠3亿美元。
芝加哥大学商学院领先采用学系式方法进行商业研究，其方法已经获得其他商学院所效仿。商学院学术独立、教学方法强调理论基础，和哈佛商学院的案例教学形成鲜明比较，各成一派。芝加哥大学商学院的拥有国际知名的教学人员，并且在多项领域拥有一流实力，包括金融、策略、国际商业、企业领导、整体管理、经济、会计、市场行销及其创新的EMBA课程——此课程的校园分设于新加坡、伦敦与芝加哥，参加该课程的学员将在所有三个校园上课。
坐落在新加坡的亚洲校园创办于2000年9月，位于陈旭年宅第（House of Tan Yeok Nee），这是一座经过保留翻新的历史建筑物，建造于1885年，拥有各种先进设施。布斯商学院计划从2014年起在香港开设EMBA课程。
