杜克大学生物医学工程专业（BME）始终在全美生物医学工程项目中排名前五位。该系的研究生项目使得学生能够很早就开始研究，广泛接触生物医学工程专业，促进学生领导能力和指导技能的发展。学校提供校外实习机会，而且最重要的，提供研究经验。
杜克大学生物医学工程项目学生需要完成核心产业预备课程和实习/项目，系要求必修课程，和以下五个领域的技术选修课程中其中一类。
成像和生物光子学（Imaging and Biophotonics）
心脏和神经工程（Cardiac and Neuroengineering）
生物材料（Biomaterials）
生物工程与组织工程（Bioengineering and Tissue Engineering）
生物力学（Biomechanics）
